Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NANOGP8Q6NSW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms