Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms