Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPPQ6IPU0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms