Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIRMAQ69YN4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms