Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms