Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC18Q5T9S5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms