Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNT1Q5JUK3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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