Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LACTB2Q53H82 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LACTB2Q53H82 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms