Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms