Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4orf17Q53FE4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms