Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms