Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYTL3Q4VX76 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms