Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BBS9Q3SYG4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS9Q3SYG4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms