Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A52Q3SY17 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A52Q3SY17 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms