Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC57Q2TAC2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms