Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms