Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FXNQ16595 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FXNQ16595 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FXNQ16595 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FXNQ16595 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms