Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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