Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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