Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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ZIC1Q15915 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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ZIC1Q15915 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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