Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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