Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF1Q15637 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF1Q15637 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF1Q15637 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF1Q15637 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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