Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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