Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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