Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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