Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD3Q15054 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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