Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3GAP1Q15042 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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