Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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