Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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CHD4Q14839 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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