Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BECN1Q14457 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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