Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SPIDRQ14159 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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SPIDRQ14159 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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SPIDRQ14159 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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SPIDRQ14159 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIDRQ14159 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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