Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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UBE4AQ14139 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4AQ14139 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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