Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE7AQ13946 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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