Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA9Q13797 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms