Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA4Q13772 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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