Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DNASE1L3Q13609 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms