Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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