Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf61Q13536 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms