Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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