Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TOP3AQ13472 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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