Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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