Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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