Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFCP2Q12800 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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