Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMA1Q12791 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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