Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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