Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGXB3Q12766 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
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