Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 YLR302CYLR302C 363 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 PRE8YML092C 753 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 HHT2YNL031C 411 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 ESF2YNR054C 951 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 RLF2YPR018W 1821 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 GDI1YER136W 1356 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 SSF1YHR066W 1362 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 GEA1YJR031C 4227 nt2.69□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 SPR3YGR059W 1539 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 UBP16YPL072W 1500 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 YDR209CYDR209C 414 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 TIF35YDR429C 825 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 RPS12YOR369C 432 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 ARR2YPR200C 393 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 YDR239CYDR239C 2364 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 TOP2YNL088W 4287 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 DUG2YBR281C 2637 nt2.68□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 MET32YDR253C 576 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 GPI19YDR437W 423 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 MTC7YEL033W 420 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 YGL015CYGL015C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 RTS3YGR161C 792 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 CIC1YHR052W 1131 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 AFB1YLR040C 675 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 BI4Q0120 1917 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 HAA1YPR008W 2085 nt2.67□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 PUF4YGL014W 2667 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 JIP5YPR169W 1479 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 SSF2YDR312W 1362 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 PTP3YER075C 2787 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 ADK1YDR226W 669 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 PHO80YOL001W 882 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 ALG14YBR070C 714 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 FIR1YER032W 2631 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 PHR1YOR386W 1698 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 DNA2YHR164C 4569 nt2.66□□□□□ -1.98
AVL9Q12500 SKP2YNL311C 2292 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 AHC2YCR082W 387 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RPS17BYDR447C 411 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 NOP19YGR251W 591 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SPO13YHR014W 876 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 EAF6YJR082C 342 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 LSM2YBL026W 288 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 MRPL33YMR286W 261 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YNL046WYNL046W 519 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SWM2YNR004W 441 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.65□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 GCV2YMR189W 3105 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 DNL4YOR005C 2835 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YGR290WYGR290W 444 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 VPS51YKR020W 495 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 LCL1YPL056C 306 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 ISU1YPL135W 498 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 NSL1YPL233W 651 nt2.64□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 ARV1YLR242C 966 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YHC1YLR298C 696 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YLR456WYLR456W 615 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 INO80YGL150C 4470 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YIL166CYIL166C 1629 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SNU56YDR240C 1479 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 UBP15YMR304W 3693 nt2.63□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YKU80YMR106C 1890 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 GCD10YNL062C 1437 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 GPI17YDR434W 1605 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 HNT1YDL125C 477 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RPL29YFR032C-A 180 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 MPO1YGL010W 525 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 VPS20YMR077C 666 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 FPR1YNL135C 345 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 ACM1YPL267W 630 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 ESC1YMR219W 4977 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 TRS130YMR218C 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 VAC8YEL013W 1737 nt2.62□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 snR76snR76 109 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YER189WYER189W 369 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RAD6YGL058W 519 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YKL044WYKL044W 321 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RPS29AYLR388W 171 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RGM1YMR182C 636 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YPL276WYPL276W 438 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SUL1YBR294W 2580 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SMY2YBR172C 2223 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 RLI1YDR091C 1827 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YNL034WYNL034W 1839 nt2.61□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 TPS2YDR074W 2691 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 TSA2YDR453C 591 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YDR509WYDR509W 348 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 GLC7YER133W 939 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 SYS1YJL004C 612 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 GPI14YJR013W 1212 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 YNL122CYNL122C 348 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 JID1YPR061C 906 nt2.6□□□□□ -1.99
AVL9Q12500 ORC2YBR060C 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms