Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 MES1YGR264C 2256 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 OSW7YFR039C 1533 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YCR064CYCR064C 411 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 APC11YDL008W 498 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 TIM11YDR322C-A 291 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 RPS1AYLR441C 768 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 UBX4YMR067C 1251 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 IRA2YOL081W 9240 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 FIR1YER032W 2631 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.14□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SHE9YDR393W 1371 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 DBP10YDL031W 2988 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 IRC2YDR112W 309 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 MPO1YGL010W 525 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 CIC1YHR052W 1131 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PEX17YNL214W 600 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 ATP3YBR039W 936 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SPB1YCL054W 2526 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PHO91YNR013C 2685 nt2.13□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SPR3YGR059W 1539 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 FKS3YMR306W 5358 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SEN54YPL083C 1404 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 RPS26BYER131W 360 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 RTS3YGR161C 792 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YGR242WYGR242W 309 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 OTU2YHL013C 924 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 EAF6YJR082C 342 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YKR051WYKR051W 1257 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YLR252WYLR252W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YMR144WYMR144W 1029 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 HSP10YOR020C 321 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YOR331CYOR331C 558 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SIN3YOL004W 4611 nt2.12□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 MSB1YOR188W 3414 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 SGS1YMR190C 4344 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 MET32YDR253C 576 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YGR290WYGR290W 444 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 BET4YJL031C 984 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YAL037WYAL037W 804 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 BER1YLR412W 825 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 OST2YOR103C 393 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YOR364WYOR364W 369 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 ISU1YPL135W 498 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 RRG8YPR116W 834 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 RLI1YDR091C 1827 nt2.11□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 GCD10YNL062C 1437 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 BFR1YOR198C 1413 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YDL009CYDL009C 324 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PRM8YGL053W 714 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 COA4YLR218C 453 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 GAL7YBR018C 1101 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YPR014CYPR014C 330 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 snR191snR191 274 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.1□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PDR11YIL013C 4236 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PSK2YOL045W 3306 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 TAF2YCR042C 4224 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 HNT1YDL125C 477 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 DFG10YIL049W 762 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YIR020CYIR020C 303 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 MRP49YKL167C 414 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 NYV1YLR093C 762 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 HRI1YLR301W 735 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 PHO80YOL001W 882 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 YPR096CYPR096C 303 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 VID24YBR105C 1089 nt2.09□□□□□ -2.07
TIR4Q12218 DAL5YJR152W 1632 nt2.09□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 SSF1YHR066W 1362 nt2.09□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 SMY2YBR172C 2223 nt2.09□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 FUS1YCL027W 1539 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 VPS13YLL040C 9435 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 YDR220CYDR220C 294 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 ERG28YER044C 447 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 YGL015CYGL015C 393 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 AFB1YLR040C 675 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 ALG14YBR070C 714 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 DAD3YBR233W-A 285 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 APC2YLR127C 2562 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 IRC8YJL051W 2469 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 TRZ1YKR079C 2517 nt2.08□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 SAK1YER129W 3429 nt2.07□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 TPS2YDR074W 2691 nt2.07□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 NEW1YPL226W 3591 nt2.07□□□□□ -2.08
TIR4Q12218 SIP3YNL257C 3690 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.8 ms