Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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