Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms