Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms